İlçemizde hayvancılık başlıca geçim kaynakları arasında yer almaktadır. Küçükbaş ve büyükbaş hayvancılık, tavukçuluk, balıkçılık, arıcılık başlıca uğraş alanlarıdır. Buna bağlı olarak et, süt, süt ürünleri, yumurta üretebilmek, işleyebilmek için kesimhane, mandıra ve kümesler gibi iş kolları oluşmuştur.
Ayvalık’ta, 2019 yılında 6.684 büyükbaş hayvan, 30.429 küçükbaş hayvan, 6.200 arı kovanı vardır. 2019 yılı sonunda kırmızı et üretimi 217.138 ton, süt üretimi 6.324,51 ton, bal üretimi 70 ton olarak ölçülmüştür.